Thursday, November 29, 2007

Blast options for ortholog gene finding

URL :http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btm585v1


서로 다른 두 species 간의 ortholog 를 찾는 방법은
Reciplocal best blast hit,
Reciplocal best distance hit
방법 등 여러가지가 있는데, blast를 이용한 방법이
사용의 편의성에 기인해 널리 쓰인다.

위의 논문에서는 Blast option을 바꾸는 것 만으로
ortholog finding accuracy를 높이는 방법을
제안한다.