Wednesday, January 13, 2010

생명정보학( Bioinformatics, Computational biology) 선도 연구기관 랭킹

1000 genome project ( 1000명의 genome을 sequencing 하는 HGP 이후의 가장 큰 국제 생물학 연구 컨소시움 ) 에 참여하는 연구 그룹 중, 실험 부분을 제외한 순수 data analysis 참여자들의 숫자를 counting 하고 이 순서로 생명정보학(Bioinformatics, Computational biology) 대학/연구그룹 랭킹을 매겨봤다.

HGP, 1000 genome project 를 리딩하는 sanger 연구소가 1위, MIT와 하바드의 broad institute이 2위로 bioinformaitcs 분야를 이끌고 있는걸 확인할 수 있다.

미국 탑 대학들 중 칼텍이나 스탠포드는 분석 참여자 0명과 1명으로 이 순위 최하위권에 랭크되어 있다. 시퀀싱 프로젝트인 만큼 업계 리더들인 Applied biosystems 와 Illumina 가 10위 12위를 마크하고 있다. 또 아시아권에선 유일하게 Beijing Genome Institute이 미국의 대표적인 Bioinformatics 기관인 NCBI, Illumina와 공동으로 12위를 마크하고 있다. 유럽의 연구기관들은 1위를 차지한 Sanger institute, 5위의 Oxford, 7위 EBI, 17위의 MPI ( Max Planck Institute ) 이 상위권에 랭크되었다.

향후, Personalized genomics 가 생물학 연구의 핵심화두이자, 바이오 산업 중흥의 열쇠를 쥐고 있다는 것을 생각하면, 앞으로 박사과정 및 포닥을 위한 연구기관 선정을 고려하고 있는 경우, 이 리스트에 포함된 연구기관들과 연구자들을 적극 고려해 봄직 하다고 생각한다.

#### 1,000 Genome project, Data analysis 참여 연구자 숫자에 따른 생명정보학 연구기관 랭킹 ####
1. Sanger Institute 30
2. Broad Institute 26
3. Yale University 14
4. Cornell University 13
5. Oxford University 11
6. Baylor College of Medicine 10
6. European Bioinformatics Institute 10
6. Washington University in St. Louis 10
9. University of Chicago 9
10. Applied Biosystems 7
10. University of Michigan 7
12. Illumina 6
12. Beijing Genomics Institute, Shenzhen 6
12. National Center for Biotechnology Information 6
15. Boston College 5
15. University of California, Santa Cruz 5
17. Cold Spring Harbor Laboratory 4
17. University of Washington 4
17. Max Planck Institute for Molecular Genetics 4
20. Roche Applied Science 3
20. Louisiana State University 3
22. University of Utah 2
22. Brigham and Women's Hospital / Broad / Harvard 2
22. University of Auckland 2
22. National Human Genome Research Institute 2
22. Translational Genomic Research Institute 2
22. University of California, San Diego 2