Effect of gene mutation on phenotype

URL : http://genomebiology.com/content/pdf/gb-2007-8-11-r252.pdf

Gene mutation이 phenotype에는 과연 어떤 영향을 미칠까?
이는 SNP 연구의 핵심이 되는 질문이다.

Species간, 각 human 개체간의 genetic variation이
어떤 영향을 끼쳐, species간 혹은 개체 간의 variation을
만들어 낼까?

이 논문에서는 protein complex를 이용해 gene mutation
의 phenotypic effect를 설명한다.

Blast options for ortholog gene finding

URL :http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btm585v1


서로 다른 두 species 간의 ortholog 를 찾는 방법은
Reciplocal best blast hit,
Reciplocal best distance hit
방법 등 여러가지가 있는데, blast를 이용한 방법이
사용의 편의성에 기인해 널리 쓰인다.

위의 논문에서는 Blast option을 바꾸는 것 만으로
ortholog finding accuracy를 높이는 방법을
제안한다.